El preparador griego debutaba en la Liga dirigiendo al Valencia Basket Club, en la temporada 2006-07, equipo en el que permanecería hasta el mes de noviembre de 2008. Tras dirigir al Aris Salónica Fotis regresó a la competición en enero de 2009 para hacerse con las riendas del Uxue Bilbao Basket en sustitución del bilbaíno Txus Vidorreta.
Katsikaris, que cumple su cuarta temporada dirigiendo al conjunto bilbaíno, ha calado en la 'marea negra' y su trabajo es muy reconocido, por ello recibía recientemente el título de 'Mejor entrenador del año' en la Eurocup.
Son 123 los partidos en total que el coach heleno ha dirigido al equipo bilbaíno con un balance hasta el momento de 73 victorias por 50 derrotas en la Liga Endesa.
Los 199 partidos de Fotis Katsikaris en la Liga:
TEMPORADA EQUIPO PARTIDOS
2006-07 Valencia Basket Club 33
2007-08 Valencia Basket Club 37
2008-09 Valencia Basket Club 6
2009-10 Uxue Bilbao Basket 16
2010-11 Uxue Bilbao Basket 43
2011-12 Uxue Bilbao Basket 36
2012-13 Uxue Bilbao Basket 28