Perotti debutó con el primer equipo del Sevilla en la temporada 2008/09. Campaña en la que jugó un total de 14 encuentros y anotó un gol que significó el pase a la Liga de Campeones como tercero.
En las dos siguientes temporadas Perotti jugó 28 y 31 partidos respectivamente, pero en la siguiente temporada comenzó su calvario con las lesiones. Sólo jugó 16 partidos en toda la campaña.
De los 100 choques que ha disputado, ha ganado 50, ha empatado 20 y ha perdido 30 duelos.